Pendant deux ans, Naruto et ses compagnons ont poursuivi leur formation et sont désormais au premier rang de la lutte contre Akatsuki, une organisation secrète qui cherche à s'emparer du pouvoir des B
Naruto exécute l'Orbe Shuriken. Il doit maintenant affronter le terrible Kakuzu. Pendant ce temps, Sasuke affronte Orochimaru et le combat s'annonce d'une sauvagerie inouïe.
C'est le jour du nouvel an et aussi les 11 ans de Mikan ! Hotaru est convié à la flower garden party et Mikan reçoit une balle magique qui lui permet d'y assister.