Après des vacances mouvementées chez les Dursley, Harry Potter retrouve ses deux fidèles amis, Ron et Hermione, pour prendre le train qui les ramène à Poudlard, l'école des sorciers.
Un enfant observe une famille de lapins, un cochon qui joue dans la boue ou une chèvre qui aime bondir dans les champs et comprend que les animaux ne sont pas si différents de lui.
Rémi, P.P. Cul-Vert, et Mathilde enquêtent sur les faits étranges qui se produisent au collège dans les salles de classe, dans les sous-sols, et cherchent le coupable.
Après un horrible été, Harry, 15 ans, retourne à Poudlard. Une nouvelle enseignante lui rend la vie dure et sème la zizanie parmi les grands et les petits sorciers.