James Adams, Kyle Wilson et sa soeur Lauren font équipe dans cette nouvelle mission dont l'objectif est d'infiltrer la Milice de libération des animaux, un groupe clandestin extrémiste, qui, au nom de
Eva, 16 ans, se rend avec sa mère, son frère Anthony et Samy, le meilleur ami de ce dernier, dans une maison isolée en pleine montagne, léguée par sa grand-tante.
Cherub se voit confier la garde de Dante, un petit garçon de huit ans qui a assisté au massacre de de sa famille par le Fuhrer, chef des Vandales, une communauté de bikers du sud-ouest de l'Angleterre
Les jeunes espions se rendent à San Francisco pour enquêter sur la mort de Rutledge, un ancien espion du MI6 qui s'informait sur un traître surnommé La Pie.