Amu Hinamori, une jeune fille cool, mais en fait plutôt réservée et peu sûre d'elle, rêve d'intégrer les Gardiens, un groupe de son école chargé de la protection des élèves.
Mitsuha a grandi dans une famille japonaise traditionnelle. Elle s'ennuie dans sa vie à la montagne et rêve de connaître le rythme trépidant d'une grande ville. Taki, lui, vit à Tokyo.
Les amis arrivent au pays de Clow avec l'intention de sauver Sakura. Ils échappent à un piège de Fei-Wan et se dirigent vers les ruines où Sakura a été privée de son âme.
Avec Barô dans leur équipe, Isagi et Nagi doivent désormais affronter Kunigami, Chigiri et Reo. De force égale, les deux équipes ne peuvent se départager qu'en évoluant au cours du match.