Kôtarô et Tôru, deux voisins et amis d'enfance, sont autrefois tombés amoureux de la même jeune femme, Tôko, et ont formé un étrange triangle amoureux, jusqu'à la disparition soudaine de Tôru.
Yoh poursuit sa formation de shaman aux côtés d'Amidamaru, le samouraï centenaire. Une énorme comète vient de faire son apparition, annonçant l'avènement des Shaman Fight.