Alors que la Team Plasma s'est emparée de Zekrom, Fulguri Boréas et Démétéros, tout espoir paraît perdu. Pourtant, Zhu croit voir en Noir le salut, lui qui semble avoir été choisi par Reshiram.
Depuis qu'il a rejoint le village de Toal, Link s'est totalement intégré à la communauté. Mais il a peur que les villageois découvrent son terrible secret.
A Rumble Town, le combat touche à sa fin. Alors qu'un déferlement de fantasia semble mettre à mal la joueuse de flûte, Seth est isolé de l'affrontement par un individu dissimulé sous une cape.
Sangoku, après avoir suivi un entraînement poussé au contact du Tout Puissant, se présente à nouveau au championnat du monde des arts martiaux. Fort de son expérience, il ne néglige aucun adversaire.