Artemis a maintenant 13 ans. Persuadé que son père est toujours en vie, il se lance à sa recherche en Russie et se heurte à la mafia, lorsqu'il est enlevé par le peuple des fées.
Artemis Fowl est un jeune génie de 12 ans qui n'a qu'un seul objectif en tête : restaurer la fortune de sa famille. Il appartient en effet à une dynastie de voleurs célèbres à la fortune déclinante.
Artemis Fowl et ses amis résistent à l'attaque de robots contre la cité d'Atlantis. Mais le changement de personnalité d'Artémis inquiète ses compagnons et rend l'issue de l'aventure incertaine.