Un second kira, dont les méthodes sont celles de Light, a fait son apparition. Au quartier général d'enquête, L. contacte Light pour lui demander sa collaboration.
Deux ans ont passé. Sa formation avec Jiraya achevée, c'est un Naruto plus fort et plein d'assurance qui revient au village de Konoha. Mais la joie des retrouvailles est de courte durée.
L'histoire de deux sorcières prétendantes au poste de reine du Royaume magique. Mais avant cela, elles doivent faire un séjour chez les humains afin de s'emparer du coeur d'un maximum de garçons.
Une petite fille prénommée Hana se retrouve brusquement projetée sur ce qui semble être une île déserte. Elle y croise cependant de très sympathiques résidents qui l'accueillent chaleureusement.
C'est le jour du nouvel an et aussi les 11 ans de Mikan ! Hotaru est convié à la flower garden party et Mikan reçoit une balle magique qui lui permet d'y assister.