2241, Japon. Devenue inhabitable, la Terre n'abrite que des robots samouraïs, appelés Yojimbot. Un jour, l'un d'entre eux rencontre Hiro, un jeune garçon qui fuit une troupe armée avec son père.
1936 en Bavière, Max, enfant d'un foyer du programme Lebensborn, est nourri de la doctrine nazie dans le ventre de sa mère afin de devenir un parfait prototype de la race aryenne.
En rencontrant le seigneur Motonaga Miyoshi, qui partage les mêmes aspirations que lui, Kuhé prend conscience de ses propres faiblesses, son manque de force et d'expérience.
La suite des aventures de Kuhé, un orphelin de 14 ans en charge de son frère cadet Jinsuke dans le Japon de l'époque Sengoku. Dans un monde en guerre, il poursuit le rêve de créer un havre de paix.