Dans un avenir proche, un pirate informatique du nom de Neo, découvre par Morpheus que la réalité n'est qu'une immense simulation créée par la Matrice, réduisant l'espèce humaine en esclavage...
New York 2022. Un brouillard a envahi la surface du globe, tuant la végétation et la plupart des espèces animales. D'un côté, les nantis qui peuvent avoir accès à la nourriture rare et très chère.
A l'aube de l'humanité, des singes découvrent un Monolithe noir. Quatre millions d'années plus tard, le docteur Floyd va sur la lune pour enquêter sur un Monolithe noir qui émet des signes mystérieux.