Avec Sasuke et Sakura, Naruto, le pire garnement de l'école de ninjas de Konoha, un village caché, réussit avec brio le test de survie imposé par maître Kakashi.
Utau se sent abandonnée depuis qu'Ikuto est parti à l'étranger. Kûkai tente d'y remédier et leur amitié ambiguë laisse place à un sentiment plus profond.
En rencontrant le seigneur Motonaga Miyoshi, qui partage les mêmes aspirations que lui, Kuhé prend conscience de ses propres faiblesses, son manque de force et d'expérience.
La suite des aventures de Kuhé, un orphelin de 14 ans en charge de son frère cadet Jinsuke dans le Japon de l'époque Sengoku. Dans un monde en guerre, il poursuit le rêve de créer un havre de paix.