Après qu'un ordre de mobilisation d'urgence a été lancé, la classe S se réunit au quartier général de l'Association des héros. Saitama, de la classe B, s'invite à la réunion.
Saitama est soulagé d'apprendre qu'il est remonté dans le classement des héros. Mais il n'a pas le temps de souffler car il découvre qu'une météorite menace la terre.
Nathan, un écolier ordinaire, trouve Whisper, un yo-kai, au cours d'une promenade dans la forêt. Ce dernier lui offre une montre magique qui révèle la présence de tous les yo-kai aux alentours.
Le roi Andragoras règne d'une main de fer dans le royaume de Parse. Mais les trésors de sa capitale, Ecbatâna, attisent les convoitises des puissances ennemies qui passent à l'attaque.