Yoh poursuit sa formation de shaman aux côtés d'Amidamaru, le samouraï centenaire. Une énorme comète vient de faire son apparition, annonçant l'avènement des Shaman Fight.
Dans une communauté baptisée Notre Monde, les kamis, dieux protecteurs géants, sont craints. Sutekichi sacrifie un jour l'une de ses jumelles pour éviter une sécheresse.