Merlin a enfin retrouvé le goût de vivre et souhaite maintenant faire le bonheur des gens. Pour cela, Tom et Léa doivent remplir de nouvelles missions.
Merlin a laissé à Tom et Léa une lettre inquiétante : un sorcier cherche à dérober les secrets de quatre magiciens. Les deux enfants partent à Paris en 1889 où a lieu l'Exposition universelle.
Tom et Léa partent au pays des manchots empereurs !La fée Morgane envoie les deux enfants chercher le dernier secret du bonheur pour sauver Merlin qui a perdu le goût de vivre.
Tom et sa soeur Léa sont projetés par la cabane magique en Irlande au Moyen Age. Ils doivent récupérer un livre contenant une légende, dans un monastère.
Missionés par Merlin, Tom et Léa partent à la recherche d'artistes de talent. Ils se retrouvent en Irlande, en 1862, et rencontrent Augusta Grégory, une joueuse de flûte irlandaise.