Yoh poursuit sa formation de shaman aux côtés d'Amidamaru, le samouraï centenaire. Une énorme comète vient de faire son apparition, annonçant l'avènement des Shaman Fight.
Avec Sasuke et Sakura, Naruto, le pire garnement de l'école de ninjas de Konoha, un village caché, réussit avec brio le test de survie imposé par maître Kakashi.