Dans une paisible forêt, les reliefs d'un pique-nique déclenchent une guerre sans merci entre deux bandes rivales de fourmis convoitant le même butin : une boîte de sucres !
Le docteur Yung a mis au point un système qui lui permet de créer n'importe quel Pokémon ayant existé... Les Pokémons issus de cette technologie sont baptisés les "Pokémons mirages"...
Alors qu'ils traversent une forêt, Sacha et Pikachu découvrent un jeune garçon inconscient, Sammy, et le légendaire Pokémon Célébi, blessé. Les deux compagnons viennent du passé.