A l'aube de l'humanité, des singes découvrent un Monolithe noir. Quatre millions d'années plus tard, le docteur Floyd va sur la lune pour enquêter sur un Monolithe noir qui émet des signes mystérieux.
Dans un avenir proche, un pirate informatique du nom de Néo, découvre grâce à Morpheus que la réalité n'est qu'une immense simulation créée par la Matrice, réduisant l'espèce humaine en esclavage.