Elevé sur Apokolyps, une planète-usine dirigée par l'implacable Darkseid, Scott Free a réussi à s'échapper pour rejoindre la Terre, où il rencontre son mentor, un artiste de l'évasion connu sous l'ali
Après un tremblement de terre, Gotham City est abandonnée par les autorités. Des mois plus tard, Batman revient pour reprendre la ville, mais celle-ci est divisée en fiefs régis par ses pires ennemis.
En 1957, l'URSS envoie la chienne Laïka en orbite autour de la Terre. Deux ans plus tard, les Etats-Unis réitèrent l'expérience avec deux singes, Able et Baker.
Talia al Ghul présente à Batman leur fils caché, Damian. Celui-ci, assassin célèbre, s'en prend à Robin. Batman doit se plonger dans son passé pour déterminer quels sont ses ennemis et ses alliés.