Alors que Mikan pensait avoir réussi à se rapprocher de Natsumé, l'énigmatique garçon semble redevenu froid et distant. Mikan apprend qu'il est de constitution fragile.
Un cadavre a été découvert dans la forêt de Kashiragami. Kogoro, Ran et Conan se rendent alors sur les lieux pour enquêter et découvrent qu'un certain Kogoro Mouri est déjà sur les lieux !