La deuxième tentative d'Athéna pour récupérer le Palladion et retrouver enfin Pallas s'est terminée dans un bain de sang. Troie a été saccagée par Héraclès et son armée.
A la suite de l'accession au trône de Jacquard, le frère du roi Thibault, Ema, Lysandre, Lucas et tous les habitants du Royaume de Pierre d'Angle s'apprêtent à subir un gouvernement implacable et brut
Après la mort de Mina, Biomedicare continue de traquer les génophores. Ces derniers ne peuvent plus fuir et doivent mener leur ultime bataille pour mettre fin à la propagation du virus et se libérer.
Au décès de leur père, le lycéen Auguste et Césarine, sa petite soeur autiste, sont plongés malgré eux dans une guerre secrète opposant depuis des siècles la Confrérie et les Autodafeurs.
NIHIL est le centre d'un monde composé d'îles. Aanj est à la recherche de son frère, Grethe navigue autour de NIHIL, tandis qu'Askold et Jeremias sont en prison pour avoir tué le fils du roi.