L'heure de la rentrée a sonné pour Pico, qui retrouve l'école et ses camarades de classe. Lorsqu'il découvre un livre sur l'étymologie, une nouvelle dimension s'offre à lui.
Tom et sa soeur Léa, grâce à leur cabane magique, sont propulsés à l'époque des pirates et vont devoir ruser pour échapper aux cruels pilleurs des mers.