Lyra, l'enfant de la prophétie, et Will, porteur du Poignard Subtil, s'engagent pour une odyssée en direction d'un endroit dont nul n'est jamais revenu.
20 ans après la destruction de la civilisation moderne, Joel, un survivant endurci, est engagé pour faire sortir Ellie, une jeune fille de 14 ans, d'une zone de quarantaine oppressante.