Les mages de la guilde Fairy Tail sont désormais engagés dans la Quête de cent ans, qui consiste à neutraliser les cinq Dieux-Dragons de Guiltina, le continent inconnu.
Tandis que les membres de Fairy Tail tentent de reformer la guilde, Natsu parvient à résoudre les deux grandes énigmes concernant la dissolution du groupe et les raisons de l'absence de Makarof.