La Fairy Tail doit affronter la guilde clandestine d'Eizen Wald. Celle-ci s'est emparée de la terrible Lullaby, une flûte maléfique dont le son tue tous ceux qui l'entendent.
En rencontrant le seigneur Motonaga Miyoshi, qui partage les mêmes aspirations que lui, Kuhé prend conscience de ses propres faiblesses, son manque de force et d'expérience.
La suite des aventures de Kuhé, un orphelin de 14 ans en charge de son frère cadet Jinsuke dans le Japon de l'époque Sengoku. Dans un monde en guerre, il poursuit le rêve de créer un havre de paix.
Mitsuha a grandi dans une famille japonaise traditionnelle. Elle s'ennuie dans sa vie à la montagne et rêve de connaître le rythme trépidant d'une grande ville. Taki, lui, vit à Tokyo.