Alors qu'Amédée apprend qu'il est gravement malade, les Espions de famille reprennent du service pour une nouvelle mission. Mais cette fois-ci, des tensions se font sentir au sein du groupe...
Niko, 10 ans, vit avec ses parents inventeurs qui créent de nouveaux objets dont une machine à défaire le temps, un petit frère robot obéissant et un rayon laser qui rend tout appétissant.
Léna n'autorise les enfants à sortir de l'internat que lorsque la nuit est tombée. Mais, fatigués de se cacher, Ulysse et ses compagnons partent pour une dernière enquête.