Une adaptation illustrée de 67 épisodes de la Bible, de la création du monde à Pierre, le premier pape, en passant par le déluge, le sacrifice d'Isaac, la traversée de la mer Rouge, Samson et Dalila,
Les Oracion Seis ont enlevé Wendy, qui est détentrice d'un grand pouvoir de guérison. Brain et les siens veulent ressusciter un homme capable de retrouver le Nirvana.
Erza et Gérald se battent contre Midnight, le plus puissant des Oracion Seis. Pendant ce temps Lucy, Grey, Natsu et Jera tentent de stopper le nirvana qui s'approche de la guilde des Cait Shelter.
Lucy affronte la terrible Angel, et Brain prend le contrôle du nirvana. Natsu et ses compagnons semblent être le dernier espoir pour empêcher le monde de sombrer dans les ténèbres...