L'espèce humaine est menacée d'extinction par une pandémie mondiale. Le génome des survivants est modifié, certains évoluent tandis que les autres régressent.
En 2049, suite à la propagation d'un agent non viral mais mortel, les enfants atteints sont placés dans des cocons de robots. Kai fait partie de ces enfants.
Kate Warner, scientifique émérite, s'est installée à Jakarta pour tenter de surmonter un traumatisme lié à son passé. Ses recherches ont abouti à un traitement de l'autisme.
Emma Matthews et James Sinclair semblent mener une existence presque normale sur le Camp Sept. Mais la Nasa découvre que des astéroïdes filent droit sur la Terre.