Léna n'autorise les enfants à sortir de l'internat que lorsque la nuit est tombée. Mais, fatigués de se cacher, Ulysse et ses compagnons partent pour une dernière enquête.
Mitsuha a grandi dans une famille japonaise traditionnelle. Elle s'ennuie dans sa vie à la montagne et rêve de connaître le rythme trépidant d'une grande ville. Taki, lui, vit à Tokyo.