Yoh poursuit sa formation de shaman aux côtés d'Amidamaru, le samouraï centenaire. Une énorme comète vient de faire son apparition, annonçant l'avènement des Shaman Fight.
Sacha, Jade et le chien Tomcrouz sont coincés en Chine en l'an 1650. Leur seule solution est de créer une boucle temporelle pour repartir vers le passé et retrouver le parchemin égaré.
Dans un monde où le dérèglement climatique s'est brusquement généralisé, l'eau potable est devenue un trésor et la survie individuelle une obsession pour chacun.