Paris, 1789. Après la disparition de son père lors d'une émeute, Michel, 11 ans, vit dans un refuge où il est maltraité. Un jour, il poursuit une voleuse de pain sur les toits de la ville.
Depuis leur planque sur les toits de Paris, Michel prépare avec ses nouveaux amis l'évasion de son père de la Bastille, où il serait emprisonné depuis les récentes émeutes.
A Mulhouse, dans les années 1830, Nicolas Koechlin, l'homme le plus riche d'Alsace, démarre la construction de la plus grande ligne ferroviaire internationale de l'époque, qui relie Strasbourg à Bâle.
Enlevée lorsqu'elle avait 2 ans, Yona grandit auprès de Jerusza dans une forêt isolée d'Europe de l'Est. En 1941, à la mort de cette dernière, Yona s'aventure pour la première fois hors de la forêt.