Le scientifique Myles et l'énergique Beckett, des jumeaux de 11 ans, passent la nuit seuls dans la maison des Fowl alors que leur frère aîné Artemis est en mission sur Mars.
Shasta s'échappe avec Bree, un cheval doué de parole, et font route vers Narnia, avec une jeune fille de Calormen qui fuit un mariage imposé. Le voyage est riche en péripéties et rencontres étranges.
Artemis Fowl et ses amis résistent à l'attaque de robots contre la cité d'Atlantis. Mais le changement de personnalité d'Artémis inquiète ses compagnons et rend l'issue de l'aventure incertaine.