La terrible Collectionneuse a encore frappé. Elle a kidnappé les enfants et les retient prisonniers. Ursula, Jai, Max et Geni embarquent à bord de leur sous-marin et foncent vers l'île des pirates.
Artemis Fowl et ses amis résistent à l'attaque de robots contre la cité d'Atlantis. Mais le changement de personnalité d'Artémis inquiète ses compagnons et rend l'issue de l'aventure incertaine.