Boruto, considéré comme un traître ayant assassiné Naruto, est recherché depuis trois ans. Il refait son apparition lorsque Code et les sbires de crasses attaquent le village caché de Konoha.
Léon, un garçon rêveur et avide d'aventures, vit au milieu des fjords avec la prudente Chonchon, sa brebis de compagnie. Un jour, sur le chemin du village, un petit cochon tombe du ciel.
Avec Sasuke et Sakura, Naruto, le pire garnement de l'école de ninjas de Konoha, un village caché, réussit avec brio le test de survie imposé par maître Kakashi.