Lara Croft, 21 ans, n'a ni projet, ni ambition : fille d'un explorateur excentrique porté disparu depuis sept ans, cette jeune femme rebelle et indépendante refuse de reprendre l'empire de son père.
Dans un avenir proche, un pirate informatique du nom de Néo, découvre grâce à Morpheus que la réalité n'est qu'une immense simulation créée par la Matrice, réduisant l'espèce humaine en esclavage.
Des nuées de sentinelles approchent... Les Agents Smith se multiplient... Néo vole... L'Elu, doté de nouveaux pouvoirs étonnants, pourra-t-il arrêter la progression des machines ?