Boruto, considéré comme un traître ayant assassiné Naruto, est recherché depuis trois ans. Il refait son apparition lorsque Code et les sbires de crasses attaquent le village caché de Konoha.
Dans les montagnes Rocheuses du Yukon, Raian, le vieux chef des Indiens Nahanni, emmène Mohawks, son arrière-petit-fils, jusqu'à la pierre sacrée de la tribu.
Lorsque Vina, sa fille, est exclue du lycée pour avoir menacé un camarade, Elisabeth se réfugie avec elle en Alsace, dans la maison de son grand-oncle Thomas.