L'expérience 626 s'échappe d'un vaisseau de patrouille, qui s'écrase par la suite sur l'archipel japonais d'Okinawa. Stitch se retrouve alors chez la petite Yuna.
Alors que Yuken Enma rentre de son entraînement de kendo, il est emmené par une calèche dans le monde de Twisted-Wonderland où se trouve une université magique, composée de sept dortoirs, dont la mais
Stitch l'extraterrestre continue de faire des bêtises, au grand désespoir de Yuna qui s'efforce de lui faire réaliser quelques bonnes actions afin de remettre la créature sur le droit chemin.