Koro Sensei est un être tout-puissant et mystérieux qui devient enseignant de la classe 3-E de l'école secondaire de Kunugigaoka après avoir détruit la Lune et promis de faire exploser la Terre au moi
Suite des aventures d'Akito Takagi, le meilleur élève de la classe qui souhaite que son ami Moritaka Mashiro, très doué en dessin, transpose ses scénarios en manga.
Moritaka Mashiro possède un don pour le dessin. Il est amoureux de Miho Azuki mais n'ose pas le lui dire. Son ami Akito Tagaki, qui écrit des scénarios de manga, force le destin.
Des tranches de vie mettent en scène divers personnages : des collégiens, un père qui se fait licencier ou encore une jeune femme qui retrouve une ancienne lettre qu'elle a écrite pour elle-même cinq