En quête de puissance, Sasuke s'élance sur Naruto, son ami le plus cher, avec une détermination redoutable, pour le tuer. C'est le choc entre l'Orbe Tourbillonnant et les Mille Oiseaux.
Vingt candidats s'affrontent dans des duels au sommet afin de pouvoir participer à la troisième épreuve. Kabuto a déclaré forfait, mais Sasuke, Shino et Kankurô sont qualifiés.
Pendant deux ans, Naruto et ses compagnons ont poursuivi leur formation et sont désormais au premier rang de la lutte contre Akatsuki, une organisation secrète qui cherche à s'emparer du pouvoir des B