Lors d'une soirée costumée sur un vaisseau fantôme à laquelle Kogoro et Sonoko sont invités, le capitaine, hôte de la soirée, est tué sous leurs yeux et à la surprise générale, Shinichi Kudo apparaît.
Heiji Hattori, le détective de l'Est, invite Conan et ses amis à Osaka pour les vacances d'été. Mais il se disputent pour savoir si ils iront au thêatre ou au base-ball.
Le détective lycéen Shinichi Kudo est contraint de prendre un pseudonyme, Conan Edogawa (combinaison de Conan Doyle et Edogawa Rampo, créateur du roman policier japonais), pour pousuivre son enquête s
Conan et ses amis ont fait la connaissance de Rena Mizunashi, une présentatrice de la télévision. Et voilà qu'ils découvrent qu'elle fait partie de l'organisation des hommes en noir.
Kogoro et Conan partent en mission dans une riche famille de Shizuoka. A sa demande, ils doivent élucider de manière rationnelle un problème complexe : la malédiction d'un esprit malfaisant.