Robert Langdon, professeur de symbologie à Harvard, se réveille en pleine nuit dans un hôpital de Florence. Blessé à la tête, il n'a aucun souvenir des 36 dernières heures.
Pâques 1974, dans l'île de Valö. Le pensionnat de garçons est complètement vidé, seule une petite fille d'1 an et demi est retrouvée par les forces de l'ordre.
Une enquête de Marion Briem, futur mentor de l'inspecteur Erlendur. 1972, Reykjavik. Alors que se déroule le championnat d'échecs, un jeune homme est assassiné dans une salle de cinéma.
A la fin des années 1980, quatre personnes disparaissent mystérieusement en l'espace de quelques jours. Cette affaire jamais élucidée atterrit sur le bureau du Département V.
Tandis que Lisbeth Salander coule aux Caraïbes des jours supposés heureux, Mikael Blomkvist est prêt à lancer un numéro de Millénium sur une sombre histoire de prostituées exportées des pays de l'Est.