Boruto, considéré comme un traître ayant assassiné Naruto, est recherché depuis trois ans. Il refait son apparition lorsque Code et les sbires de crasses attaquent le village caché de Konoha.
En quête de puissance, Sasuke s'élance sur Naruto, son ami le plus cher, avec une détermination redoutable, pour le tuer. C'est le choc entre l'Orbe Tourbillonnant et les Mille Oiseaux.