Son ennemi : le général russe Orlov, dont le plan machiavélique est de faire exploser une bombe atomique afin de laisser les frontières des pays d'Europe à la merci des armées soviétiques.
Son ennemi : l'inquiétant Dr No, richissime et fou dangereux, s'apprétant à dérégler le tir des fusées expérimentales américaines lancées depuis Cap Canaveral.
Un second kira, dont les méthodes sont celles de Light, a fait son apparition. Au quartier général d'enquête, L. contacte Light pour lui demander sa collaboration.
Deux ans ont passé. Sa formation avec Jiraya achevée, c'est un Naruto plus fort et plein d'assurance qui revient au village de Konoha. Mais la joie des retrouvailles est de courte durée.
L'histoire de deux sorcières prétendantes au poste de reine du Royaume magique. Mais avant cela, elles doivent faire un séjour chez les humains afin de s'emparer du coeur d'un maximum de garçons.