Boruto, considéré comme un traître ayant assassiné Naruto, est recherché depuis trois ans. Il refait son apparition lorsque Code et les sbires de crasses attaquent le village caché de Konoha.
Lors du combat contre Kashin Koji, Isshiki Ôtsutsuki apparaît enfin sous sa véritable apparence. Pour graver à nouveau un kâma sur Kawaki, et réaliser sa résurrection, Isshiki attaque Konoha !!
Contre toute attente, Temari est le vainqueur. Shikamaru a gagné la vraie bataille mais il a perdu la compétition. Cependant, les épreuves pour devenir ninja de moyenne classe ne sont pas finies.