Deux ans ont passé. Sa formation avec Jiraya achevée, c'est un Naruto plus fort et plein d'assurance qui revient au village de Konoha. Mais la joie des retrouvailles est de courte durée.
Léonard a décidé de licencier sans préavis Basile, son fidèle disciple. Son remplaçant a tout pour plaire : il résout les équations avec une grande facilité et se trouve être son propre neveu.