Accompagné de Taran, son grand rival, Sacha est transporté au temps des Mayas. Malgré leurs différends, ils doivent faire équipe pour retrouver le père de Sacha qui a mystérieusement disparu.
Déterminé à éliminer les Mythics, le Mal utilise l'énergie négative des humains et mobilise une monstrueuse armée prête à répandre la terreur sur la Terre.
Niko et son frère robot Kevin doivent poursuivre leurs parents devenus idiots à travers un zoo, s'entendre avec leurs mini-doubles et concevoir un projet d'école intergalactique.
Après des années passées loin du monde des humains, les frères Tortues entreprennent de gagner le coeur des New-Yorkais et d'être acceptés comme des adolescents normaux grâce à des actes héroïques.